HPC/tungregning, databehandling og analyse med Colossus i TSD
Colossus er HPC-klyngen i TSD og tilbys av UiO i samarbeid med Sigma2. Colossus-tilgang er en tjeneste på forespørsel og vil gi deg tilgang til en liten UiO-allokering som standard. Vi anbefaler sterkt at du benytter de mye større Sigma2 HPC-ressursene på Colossus, dette får du til ved å sende en søknad til.
±·Ã¸°ì°ì±ð±ô³Ù²¹±ô±ô
Colossus er en klynge designet for å håndtere flere samtidige jobber og imøtekomme brukere med forskjellige krav. Klyngeprofilen er for parallelle applikasjoner med høye minne- og/eller IO-krav. Colossus består av 57 beregningsnoder, 4 noder med mye minne, 6 GPU-akselererte noder og 2 FPGA-akselererte bioinformatikknoder som kjører CentOS 7. Nodene er koblet sammen via Infiniband-interconnect til et 3PB+ IBM ESS GPFS-filsystem.
Tildelinger
Ressursene er delt på 3 allokeringer og tilgang avhenger av om kvote/ressurser er tildelt prosjektet:
- Sigma2-tildeling: tilgjengelig for prosjekter som har
- TSD/UiO-allokering: tilgjengelig for alle TSD-prosjekter med HPC-tilgang
- Dedikerte ressurser: flere prosjekter har anskaffet en eller flere noder for eksklusiv tilgang
Ressurser per tildeling
Følgende ressurser er tilgjengelige per tildeling:
| Allokering | Node type | Allokerbare enheter: tilgjengelige ressurser (per node) |
|---|---|---|
|
Sigma2 (--account=pXX) |
24 beregningsnoder |
kjerner: 64 (2x AMD EPYC 7551/7452 32-kjerner prosessorer) minne: 503 GiB |
|
2 GPU aksellererte noder (--partition=accel) |
kjerner: 96 (2x AMD EPYC 7642 48-kjerner prosessorer) minne: 982 GiB gpu: 4 (Nvidia Tesla A100 40GB) |
|
|
4 bigmem noder (--partition=bigmem) |
kjerner: 128 (2x AMD AMD EPYC 7702 64-kjerner prosessorer) minne: 3955 GiB lokal scratch: 7 TiB NVMe disk NOTE: Sigma2 har allokert disse til en dedikert ressurs fra 230710 til 231001. |
|
|
TSD/UiO (--account=pXX_tsd) |
5 beregningsnoder |
kjerner: 64 (2x AMD EPYC 7551 32-kjerner prosessorer) minne: 503 GiB |
|
2 GPU aksellererte noder (--partition=accel) |
kjerner: 64 (2x AMD EPYC 7551 32-kjerner prosessorer) minne: 503 GiB gpu: 2 (Nvidia Tesla V100 32GB) |
|
|
Dedikerte ressurser (--account=pXX_reservation) |
28 beregningsnoder |
kjerner: 64 (2x AMD EPYC 7551/7452 32-kjerner prosessorer) minne: 503 GiB |
|
2 GPU aksellererte noder (--partition=accel) |
kjerner: 64/96 (2x AMD EPYC 7551 32-kjerner/7552 48-kjerner prosessorer) minne: 503 GiB gpus: 2 (Nvidia Tesla V100 32GB) |
|
|
2 FPGA aksellererte Dragen (--account=pXX_dragen) |
kjerner: 24 (2x Intel Xeon Gold 6226 12-kjerner prosessorer) minne: 250 GiB Illumina Dragen programvare |
³§Ã¸°ì i veiledningene
Ring oss
Vi har åpent mellom 08:30 og 17:00 på hverdager,
og mellom 10:00 og 15:00 på lørdager.
Telefonnummer: 22 84 00 04
Send inn sak til oss
Du kan sende inn din forespørsel via e-post til: it-hjelp@uio.no.
Gå til e-postBook et videomøte over Zoom
Er du student eller ansatt kan du avtale veiledningstime hos UiO Helpdesk over Zoom. Tilgjengelige tider er tirsdag til torsdag mellom 11:00 og 13:00.
Book et videomøte